3D+t sejtgráf-kutatás

Hangoljuk a detekciót és a követést ugyanarra a célfüggvényre.

Állítsd a sejtsűrűséget, a mozgást, a detektor hibáit és a linkelési kaput. A szimuláció megmutatja, hogyan változik az él-, az osztódási és a kombinált pontszám.

score = adjusted edge Jaccard + 0,1 × division Jaccard

Interaktív labor

Tracking-szimuláció

Képkocka 1 / 20
Valódi sejt Illesztett predikció Hamis predikció Prediktált pálya
Kombinált score 0,000 Sűrű ground-truth közelítés
Adjusted edge Jaccard 0,000 TP 0 · FP 0 · FN 0
Division Jaccard 0,000 TP 0 · FP 0 · FN 0
Prediktált / valódi node 0,00× Node-büntetés: 1,000×

Célzott valós minta

Mit mutat az első EDA?

Kaggle versenyoldal ↗
Annotációs lefedettség 0,202%

52 címkézett pont a 25 755 becsült teljes csomópontból.

Medián mozgás 2,883 µm

A 95. percentilis 6,292 µm, a maximum 7,814 µm.

Voxelméret z : xy 4 : 1

A `(1,4,4)` pooling közel izotróp munkateret ad.

Képkockánkénti eltolódás

A p99 intenzitás közel 25%-ot változott

Az abszolút küszöb helyett képkockánkénti kvantilisnormalizálást érdemes tesztelni.

1 283 1 419 1 436 1 368 1 145 t0 t25 t50 t75 t99

Következő kísérletek

Négy elsődleges hipotézis

  1. H1
    Anizotrópia-korrekció

    A 4:1 laterális pooling javítja a detekciót és csökkenti a futásidőt.

  2. H2
    Node-budget kalibráció

    A küszöböt a becsült teljes sejtszámhoz kell igazítani a túlpredikciós büntetés miatt.

  3. H3
    9–10 µm trackingkapu

    A 7 µm értékelési kapu túl szűk jelöltkapu: a mintában van 7,814 µm-es valódi él.

  4. H4
    Embrió-szintű validáció

    A rejtett teszt embrió-diszjunkt, ezért a véletlen frame split optimista lenne.